НачатьНачать бесплатно

Работа с Biostrings

Используя короткую последовательность (dna_seq) из объекта zikaVirus, вам предстоит применить два биологических процесса: транскрипцию и трансляцию.

В первых двух частях упражнения вы будете выполнять эти процессы по отдельности. В последней части вы объедините их в один шаг.

В этом упражнении используется небольшая последовательность, однако помните: возможности Biostrings раскрываются в полной мере при работе с гораздо более длинными последовательностями.

Пакет Biostrings уже загружен. С помощью объекта zikaVirus выполните трансляцию первых 21 символа в объект AAString.

Это упражнение является частью курса

Введение в Bioconductor на R

Посмотреть курс

Интерактивное практическое упражнение

Попробуйте выполнить это упражнение, дополнив этот пример кода.

# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq

# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq) 
rna_seq
Редактировать и запускать код