Изучение генома вируса Зика
Пришло время изучить геном вируса Зика, который загружен в рабочую среду под именем zikaVirus. Геном был загружен с сайта NCBI, и вы можете применять функции Biostrings, чтобы узнать о нём больше.
Начните с проверки алфавита последовательности.
alphabet() # Показывает буквы, входящие в последовательность
alphabetFrequency() # Показывает количество вхождений каждой буквы
Вспомните из видео: каждый алфавит соответствует определённому контейнеру Biostrings, и каждый алфавит, как правило, содержит дополнительные кодовые буквы и символы.
Это упражнение является частью курса
Введение в Bioconductor на R
Интерактивное практическое упражнение
Попробуйте выполнить это упражнение, дополнив этот пример кода.
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
___