O fereastră de secvență
Pentru a împărți temporar secțiunile secvențelor tale, vei folosi conceptul de ferestre cu lățimi specificate, care se pot deplasa în pași. Așa cum ai văzut în videoclip, GRanges oferă funcția slidingWindows(), cu argumente precum width și step.
slidingWindows(x, width, step = 1L)
Obiectul GRanges numit ABCD1, cu id-ul genei 215 și lungimea 19895, a fost preîncărcat pentru acest exercițiu. Folosește funcția ranges() pentru a-i vedea structura.
ranges(ABCD1)
Dacă ai nevoie de exact 2 ferestre folosind step = 1L, care este numărul maxim permis pentru lățimea fiecărei ferestre?
Acest exercițiu face parte din cursul
Introducere în Bioconductor în R
Exercițiu interactiv practic
Transformă teoria în practică cu unul dintre exercițiile noastre interactive
Începe exercițiul