Explorarea secvenței virusului Zika
Este rândul tău să explorezi genomul virusului Zika, care a fost încărcat în spațiul de lucru ca zikaVirus. Genomul a fost descărcat de pe NCBI și poți aplica funcții din Biostrings pentru a afla mai multe despre el.
Începe prin a verifica alfabetul secvenței.
alphabet() # Afișează literele incluse în secvență
alphabetFrequency() # Afișează numărul de apariții per literă
Amintește-ți din video că fiecare alfabet corespunde unui container Biostrings specific și că fiecare alfabet are, de obicei, litere și simboluri suplimentare de cod.
Acest exercițiu face parte din cursul
Introducere în Bioconductor în R
Exercițiu interactiv practic
Încearcă acest exercițiu completând acest cod de exemplu.
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
___