Funcții comune de manipulare a secvențelor
Până acum, ai învățat cele mai comune funcții de manipulare a secvențelor:
reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()
În practică, poți manipula secvențe foarte mari cu ajutorul acestor funcții.
Totuși, pentru a vedea valoarea și rezultatele lor în acest exercițiu, vei folosi un subset mic. Obiectul zikv, pe care l-ai extras anterior din genomul Zika, conține doar 30 de baze.
Acest exercițiu face parte din cursul
Introducere în Bioconductor în R
Instrucțiuni pentru exercițiu
Testează funcțiile folosind zikv:
- Inversează secvența.
- Calculează complementul secvenței.
- Calculează complementul invers al secvenței.
- Translatează secvența.
Exercițiu interactiv practic
Încearcă acest exercițiu completând acest cod de exemplu.
# Reverse the zikv sequence
reverse(___)
# Complement the zikv sequence
___
# Reverse complement the zikv sequence
___
# Translate the zikv sequence
___