ÎncepețiÎncepe gratuit

Eliminarea duplicatelor

Este întotdeauna o bună practică să verifici că citirile tale de secvențe nu conțin prea multe duplicate.

# Sample with duplicates of class: ShortReadQ
dfqsample

# Get the reads from dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)

# Counting duplicates
table(srduplicated(mydReads))

Cum ai proceda pentru a elimina citirile duplicate dintr-un fișier? Acordă atenție condiției care trebuie folosită în acest filtru.

Acest exercițiu face parte din cursul

Introducere în Bioconductor în R

Vezi cursul

Exercițiu interactiv practic

Transformă teoria în practică cu unul dintre exercițiile noastre interactive

Începe exercițiul