Eliminarea duplicatelor
Este întotdeauna o bună practică să verifici că citirile tale de secvențe nu conțin prea multe duplicate.
# Sample with duplicates of class: ShortReadQ
dfqsample
# Get the reads from dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)
# Counting duplicates
table(srduplicated(mydReads))
Cum ai proceda pentru a elimina citirile duplicate dintr-un fișier? Acordă atenție condiției care trebuie folosită în acest filtru.
Acest exercițiu face parte din cursul
Introducere în Bioconductor în R
Exercițiu interactiv practic
Transformă teoria în practică cu unul dintre exercițiile noastre interactive
Începe exercițiul