Gráficos de densidade da cadeia de Markov

Enquanto um gráfico de trajetória (trace plot) captura o comportamento longitudinal de uma cadeia de Markov, um gráfico de densidade mostra a distribuição final dos valores da cadeia. Por sua vez, o gráfico de densidade fornece uma aproximação do modelo a posteriori. Você vai construir e analisar gráficos de densidade da cadeia \(m\) abaixo. Os objetos mcmc.list sleep_sim e o data frame sleep_chains estão no seu ambiente de trabalho:

sleep_sim <- coda.samples(model = sleep_jags, variable.names = c("m", "s"), n.iter = 10000)
sleep_chains <- data.frame(sleep_sim[[1]], iter = 1:10000)

Este exercicio faz parte do curso

Modelagem Bayesiana com RJAGS

Ver curso

Instruções do exercicio

Aplique plot() a sleep_sim com trace = FALSE para construir gráficos de densidade para as cadeias \(m\) e \(s\).
Aplique ggplot() a sleep_chains para reconstruir um gráfico de densidade da cadeia \(m\).

exercicio interativo prático

Tente este exercicio completando este código de exemplo.

# Use plot() to construct density plots of the m and s chains


# Use ggplot() to construct a density plot of the m chain
ggplot(___, aes(x = ___)) + 
    ___()

Editar e Executar Código