1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Hierarchické a smíšené modely s náhodnými efekty v R
Connected

Cvičení

Data z toxikologie

Toxikoložka zkoumá, zda vystavení chemické látce zvyšuje mortalitu s rostoucí dávkou. Testovací organismy vystavila různým dávkám chemické látky a zaznamenala počet uhynulých v každé testovací nádrži. Každá dávka byla opakována ve třech různých dnech.

Nejprve sestav GLM. Jednoduchý model usnadňuje ladění a zároveň ho později porovnáš s GLMER. Tento model zahrnuje dose a replicate jako fixní efekty.

Poté sestav GLMER. Tentokrát je dose fixním efektem a replicate slouží jako náhodný intercept.

Nakonec si prohlédni odhady koeficientů pomocí coef() z obou modelů. Všimni si, jak se zobrazení interceptů v jednotlivých modelech liší.

Pokyny 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • Vytvoř glm_out – model glm(), který predikuje mortality jako funkci dose a replicate. Odhadni intercept pro každou skupinu replikátu pomocí replicate - 1.
  • Prohlédni si odhady koeficientů modelu pomocí coef().