Data z toxikologie
Toxikoložka zkoumá, zda vystavení chemické látce zvyšuje mortalitu s rostoucí dávkou. Testovací organismy vystavila různým dávkám chemické látky a zaznamenala počet uhynulých v každé testovací nádrži. Každá dávka byla opakována ve třech různých dnech.
Nejprve sestav GLM. Jednoduchý model usnadňuje ladění a zároveň ho později porovnáš s GLMER. Tento model zahrnuje dose a replicate jako fixní efekty.
Poté sestav GLMER. Tentokrát je dose fixním efektem a replicate slouží jako náhodný intercept.
Nakonec si prohlédni odhady koeficientů pomocí coef() z obou modelů. Všimni si, jak se zobrazení interceptů v jednotlivých modelech liší.
Toto cvičení je součástí kurzu
Hierarchické a smíšené modely s náhodnými efekty v R
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Fit glm_out and look at its coefficient estimates
glm_out <- glm(___ ~ ___ + ___,
family = "___", data = df)
coef(___)