Chlamydie podle věkových skupin a krajů
Počet infekcí se mění v čase a liší se mezi věkovými skupinami. Možné příčiny zahrnují kulturní, sociální a politické faktory. U malých populací počet infekcí často obsahuje nuly a nemusí odpovídat normálnímu rozdělení. Pro taková data se hodí Poissonův model.
V tomto cvičení se podíváš na to, jak se výskyt chlamydiových infekcí liší v malých krajích státu Illinois. Zaměříš se na dvě otázky:
- Liší se počet hlášených případů mezi věkovou skupinou 15–19 let a skupinou 20–24 let?
- Mění se počet hlášených případů v čase pro tyto dvě věkové skupiny?
Data pocházejí od státu Illinois, který zveřejňuje přehledy infekcí, jako je chlamydie, rozdělené podle věkových skupin a krajů.
Nejdřív na data natrénuj Poissonův model pomocí glmer.
Pak si prohlédni výsledky.
V dalším cvičení data vizualizuješ.
Upozornění: Pokud uděláš chybu ve vzorci, může R spadnout. To je jedna z nástrah při použití lmer() a glmer().
Toto cvičení je součástí kurzu
Hierarchické a smíšené modely s náhodnými efekty v R
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Load lmerTest
library(lmerTest)
# Age goes before year
model_out <- ___
summary(___)