Хромосома X людського геному
Тепер ваша черга скористатися пакетом TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene і витягти з нього інформацію. Як у відео, ви виберете підмножину всіх генів на хромосомі X, використовуючи функцію genes() з аргументом filter, установленим на вибір випадків, де tx_chrom = "chrX". Потім ви дослідите цю підмножину генів.
Пам'ятайте, що filter отримує list() із умовами фільтрації, щоб вибрати конкретні інтервали геному.
Якщо хочете спробувати інші фільтри, коректні назви для цього списку: "gene_id", "tx_id", "tx_name", "tx_chrom", "tx_strand", "exon_id", "exon_name", "exon_chrom", "exon_strand", "cds_id", "cds_name", "cds_chrom", "cds_strand" та "exon_rank".
Ця вправа є частиною курсу
Вступ до Bioconductor в R
Інтерактивна практична вправа
Спробуйте виконати цю вправу, доповнивши цей зразок коду.
# Load human reference genome hg38
library(___)
# Assign hg38 to hg, then print it
___
hg