Вікно послідовності
Щоб тимчасово розбити ваші послідовності на частини, використовуйте концепцію вікон заданої ширини, які можуть пересуватися кроками. Як ви бачили у відео, GRanges має функцію slidingWindows() з аргументами width і step.
slidingWindows(x, width, step = 1L)
Об'єкт GRanges під назвою ABCD1 з ідентифікатором гена 215 і довжиною 19895 попередньо завантажено для цієї вправи. Використайте функцію ranges(), щоб подивитися його структуру.
ranges(ABCD1)
Якщо вам потрібно рівно 2 вікна з step = 1L, якою буде максимально допустима ширина кожного вікна?
Ця вправа є частиною курсу
Вступ до Bioconductor в R
Практична інтерактивна вправа
Перетворіть теорію на практику за допомогою однієї з наших інтерактивних вправ
Почати вправу