ПочатиПочніть безкоштовно

Вікно послідовності

Щоб тимчасово розбити ваші послідовності на частини, використовуйте концепцію вікон заданої ширини, які можуть пересуватися кроками. Як ви бачили у відео, GRanges має функцію slidingWindows() з аргументами width і step.

slidingWindows(x, width, step = 1L)

Об'єкт GRanges під назвою ABCD1 з ідентифікатором гена 215 і довжиною 19895 попередньо завантажено для цієї вправи. Використайте функцію ranges(), щоб подивитися його структуру.

ranges(ABCD1)

Якщо вам потрібно рівно 2 вікна з step = 1L, якою буде максимально допустима ширина кожного вікна?

Ця вправа є частиною курсу

Вступ до Bioconductor в R

Переглянути курс

Практична інтерактивна вправа

Перетворіть теорію на практику за допомогою однієї з наших інтерактивних вправ

Почати вправу