Маніпулювання з Biostrings
Використовуючи коротку послідовність (dna_seq) з об'єкта zikaVirus, тепер ваша черга попрактикуватися у двох біологічних процесах: транскрипції та трансляції.
У перших двох частинах цієї вправи ви застосуєте ці процеси окремо. У завершальній частині ви виконаєте їх за один крок.
У цій вправі ви працюватимете з дуже малою послідовністю, але пам'ятайте: справжня сила Biostrings розкривається під час обробки значно більших послідовностей.
Пакет Biostrings уже підключено для вас. Використовуючи zikaVirus, ви перекладете перші 21 символ у AAString.
Ця вправа є частиною курсу
Вступ до Bioconductor в R
Інтерактивна практична вправа
Спробуйте виконати цю вправу, доповнивши цей зразок коду.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq