1. Learn
    2. /
  2. Курси
    3. /
  3. Вступ до Bioconductor в R
Connected

Вправа

Дослідження послідовності вірусу Зіка

Тепер ваша черга дослідити геном вірусу Зіка, який завантажено у ваш робочий простір як zikaVirus. Геном завантажено з NCBI, і ви можете застосовувати функції Biostrings, щоб дізнатися про нього більше.

Почніть із перевірки алфавіту послідовності.

alphabet() # Показує, які літери містяться в послідовності
alphabetFrequency() # Показує кількість входжень кожної літери

Пам'ятайте з відео: кожному алфавіту відповідає певний контейнер Biostrings, і зазвичай кожен алфавіт має додаткові кодові літери та символи.

Інструкції 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • Використайте alphabet(), щоб дізнатися, які літери містяться в zikaVirus.