Дослідження послідовності вірусу Зіка
Тепер ваша черга дослідити геном вірусу Зіка, який завантажено у ваш робочий простір як zikaVirus. Геном завантажено з NCBI, і ви можете застосовувати функції Biostrings, щоб дізнатися про нього більше.
Почніть із перевірки алфавіту послідовності.
alphabet() # Показує, які літери містяться в послідовності
alphabetFrequency() # Показує кількість входжень кожної літери
Пам'ятайте з відео: кожному алфавіту відповідає певний контейнер Biostrings, і зазвичай кожен алфавіт має додаткові кодові літери та символи.
Ця вправа є частиною курсу
Вступ до Bioconductor в R
Інтерактивна практична вправа
Спробуйте виконати цю вправу, доповнивши цей зразок коду.
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
___