Menghapus duplikasi
Selalu merupakan praktik yang baik untuk memeriksa bahwa sequence reads Anda tidak mengandung terlalu banyak duplikasi.
# Sampel dengan duplikasi dengan kelas: ShortReadQ
dfqsample
# Ambil reads dari dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)
# Menghitung duplikasi
table(srduplicated(mydReads))
Bagaimana cara Anda menghapus reads yang terduplikasi dalam sebuah berkas? Perhatikan kondisi apa yang seharusnya digunakan pada filter ini.
Latihan ini merupakan bagian dari kursus
Pengantar Bioconductor di R
Latihan interaktif langsung
Ubah teori menjadi aksi dengan salah satu latihan interaktif kami
Mulai latihan