Mencari sebuah pola
Mari temukan beberapa kemunculan sebuah pola dalam himpunan zikaVirus menggunakan vmatchPattern(). Lalu, coba pencarian pola yang sama menggunakan matchPattern() pada satu sekuens, zikv.
# For Sets
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)
# For single sequences
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikv, max.mismatch = 1)
Kedua fungsi seharusnya menemukan jumlah kemunculan yang sama, tetapi Anda akan melihat keluaran yang berbeda. Berapa banyak kecocokan yang kita dapatkan saat menjalankan masing-masing pencarian pola secara terpisah?
Latihan ini adalah bagian dari kursus
Pengantar Bioconductor di R
Latihan interaktif praktis
Ubah teori menjadi tindakan dengan salah satu latihan interaktif kami.
Mulai berolahraga