Mulai sekarangMulai gratis

Mencari sebuah pola

Mari temukan beberapa kemunculan sebuah pola dalam himpunan zikaVirus menggunakan vmatchPattern(). Lalu, coba pencarian pola yang sama menggunakan matchPattern() pada satu sekuens, zikv.

# For Sets
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)
# For single sequences
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikv, max.mismatch = 1)

Kedua fungsi seharusnya menemukan jumlah kemunculan yang sama, tetapi Anda akan melihat keluaran yang berbeda. Berapa banyak kecocokan yang kita dapatkan saat menjalankan masing-masing pencarian pola secara terpisah?

Latihan ini merupakan bagian dari kursus

Pengantar Bioconductor di R

Lihat Kursus

Latihan interaktif langsung

Ubah teori menjadi aksi dengan salah satu latihan interaktif kami

Mulai latihan