Memanipulasi Biostrings
Dengan menggunakan sekuens pendek (dna_seq) dari objek zikaVirus, sekarang giliran Anda mencoba dua proses biologis: transkripsi dan translasi.
Pada dua bagian pertama latihan ini, Anda akan menerapkan kedua proses tersebut secara terpisah. Pada bagian terakhir, Anda akan menerapkannya dalam satu langkah.
Anda akan menggunakan sekuens yang sangat kecil pada latihan ini, tetapi ingat bahwa kekuatan Biostrings benar-benar terlihat saat memanipulasi sekuens yang jauh lebih besar.
Paket Biostrings sudah dimuat untuk Anda. Dengan menggunakan zikaVirus, Anda akan menerjemahkan 21 karakter pertama menjadi sebuah AAString.
Latihan ini adalah bagian dari kursus
Pengantar Bioconductor di R
Latihan interaktif praktis
Cobalah latihan ini dengan menyelesaikan kode contoh berikut.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq