Cromossomo X do genoma humano
Agora é a sua vez de usar o pacote TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene e extrair informações dele. Como no vídeo, você vai filtrar todos os genes no cromossomo X usando a função genes() com o argumento filter definido para selecionar instâncias em que tx_chrom = "chrX". Depois, você vai explorar esse subconjunto de genes.
Lembre-se de que filter recebe uma list() de condições de filtro para selecionar intervalos específicos do genoma.
Se quiser testar outros filtros, nomes válidos para essa lista são: "gene_id", "tx_id", "tx_name", "tx_chrom", "tx_strand", "exon_id", "exon_name", "exon_chrom", "exon_strand", "cds_id", "cds_name", "cds_chrom", "cds_strand" e "exon_rank".
Este exercício faz parte do curso
Introdução ao Bioconductor em R
Exercício interativo prático
Experimente este exercício completando este código de exemplo.
# Load human reference genome hg38
library(___)
# Assign hg38 to hg, then print it
___
hg