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Buscando por um padrão

Vamos encontrar algumas ocorrências de um padrão no conjunto zikaVirus usando vmatchPattern(). Depois, vamos tentar a mesma busca de padrão usando matchPattern() com uma única sequência, zikv.

# Para conjuntos
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)
# Para sequências individuais
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikv, max.mismatch = 1)

Ambas as funções devem encontrar o mesmo número de ocorrências, mas você vai notar uma saída diferente. Quantos acertos obtemos ao executar cada busca de padrão individualmente?

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