Funções comuns de manipulação de sequências
Até aqui, você aprendeu as funções de manipulação de sequências mais comuns:
reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()
Na prática, você pode manipular sequências realmente grandes usando essas funções.
No entanto, para ver o valor e os resultados dessas funções neste exercício, você usará um subconjunto pequeno. O objeto zikv, que você subdefiniu anteriormente a partir do genoma do Zika, tem apenas 30 bases.
Este exercício faz parte do curso
Introdução ao Bioconductor em R
Instruções do exercício
Teste as funções usando zikv:
- Inverta a sequência.
- Obtenha o complemento da sequência.
- Obtenha o reverso complementar da sequência.
- Traduza a sequência.
Exercício interativo prático
Experimente este exercício completando este código de exemplo.
# Reverse the zikv sequence
reverse(___)
# Complement the zikv sequence
___
# Reverse complement the zikv sequence
___
# Translate the zikv sequence
___