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Por que fastq?

Até aqui, você foi apresentado ao pacote ShortRead, com ferramentas úteis para as etapas iniciais da análise de leituras curtas. Em resumo, as principais funcionalidades desse pacote são:

  • Entrada de dados
  • Avaliação de qualidade
  • Transformação de dados
  • Acesso a análises subsequentes

Nesse contexto, você viu dois tipos de arquivo: fasta e fastq.

Qual você acha que é o motivo para usar arquivos no formato fastq?

Este exercicio faz parte do curso

Introdução ao Bioconductor em R

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