Removendo duplicatas
É sempre uma boa prática verificar se suas leituras de sequência não contêm duplicatas demais.
# Amostra com duplicatas da classe: ShortReadQ
dfqsample
# Obter as leituras de dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)
# Contando duplicatas
table(srduplicated(mydReads))
Como você removeria leituras duplicadas em um arquivo? Preste atenção à condição que deve ser usada nesse filtro.
Este exercício faz parte do curso
Introdução ao Bioconductor em R
Exercício interativo prático
Transforme a teoria em ação com um de nossos exercícios interativos
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