Gráficas de densidad de cadenas de Markov

Mientras que un gráfico de trazas captura el comportamiento longitudinal de una cadena de Markov, un gráfico de densidad muestra la distribución final de los valores de la cadena. A su vez, este gráfico ofrece una aproximación del modelo posterior. Vas a construir y examinar gráficos de densidad de la cadena de Markov de \(m\) a continuación. El objeto mcmc.list sleep_sim y el data frame sleep_chains están en tu espacio de trabajo:

sleep_sim <- coda.samples(model = sleep_jags, variable.names = c("m", "s"), n.iter = 10000)
sleep_chains <- data.frame(sleep_sim[[1]], iter = 1:10000)

Este ejercicio forma parte del curso

Modelado bayesiano con RJAGS

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Instrucciones del ejercicio

Aplica plot() a sleep_sim con trace = FALSE para construir gráficos de densidad para las cadenas de \(m\) y \(s\).
Aplica ggplot() a sleep_chains para volver a construir un gráfico de densidad de la cadena de \(m\).

Ejercicio interactivo práctico

Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.

# Use plot() to construct density plots of the m and s chains


# Use ggplot() to construct a density plot of the m chain
ggplot(___, aes(x = ___)) + 
    ___()

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