1. Aprender
    2. /
  2. Cursos
    3. /
  3. Giới thiệu Bioconductor trong R
Connected

Exercício

Nhiễm sắc thể X của hệ gen người

Đến lượt bạn sử dụng gói TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene và trích xuất thông tin từ đó. Giống như trong video, bạn sẽ lấy tập con gồm tất cả các gene trên nhiễm sắc thể X bằng cách dùng hàm genes() với đối số filter được đặt để chọn các trường hợp có tx_chrom = "chrX". Sau đó, bạn sẽ khám phá tập con gene này.

Hãy nhớ rằng filter nhận một list() các điều kiện lọc để chọn các khoảng hệ gen cụ thể.

Nếu bạn muốn thử các bộ lọc khác, các tên hợp lệ cho danh sách này gồm: "gene_id", "tx_id", "tx_name", "tx_chrom", "tx_strand", "exon_id", "exon_name", "exon_chrom", "exon_strand", "cds_id", "cds_name", "cds_chrom", "cds_strand", và "exon_rank".

Instruções 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • Nạp TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene bằng library(), gán vào hg, rồi in ra.