Khám phá trình tự virus Zika
Đến lượt bạn khám phá bộ gen của virus Zika, đã được nạp vào không gian làm việc của bạn dưới tên zikaVirus. Bộ gen này được tải từ NCBI và bạn có thể dùng các hàm của Biostrings để tìm hiểu thêm về nó.
Bắt đầu bằng cách kiểm tra bảng chữ cái (alphabet) của trình tự.
alphabet() # Hiển thị các ký tự có trong trình tự
alphabetFrequency() # Hiển thị số lần xuất hiện của từng ký tự
Hãy nhớ từ video rằng mỗi alphabet tương ứng với một kiểu container biostring cụ thể, và mỗi alphabet thường có thêm các ký tự/mã phụ và ký hiệu mở rộng.
Bài tập này là một phần của khóa học
Giới thiệu Bioconductor trong R
Bài tập tương tác thực hành trực tiếp
Hãy thử làm bài tập này bằng cách hoàn thành đoạn mã mẫu này.
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
___