Một cửa sổ trên trình tự
Để tạm thời chia nhỏ các phần của trình tự, bạn sẽ dùng khái niệm các cửa sổ (window) có độ rộng xác định và có thể trượt theo bước. Như bạn đã thấy trong video, GRanges cung cấp hàm slidingWindows() với các tham số như width và step.
slidingWindows(x, width, step = 1L)
Đối tượng GRanges tên ABCD1, có gene id 215 và độ dài 19895, đã được nạp sẵn cho bài tập này. Hãy dùng hàm ranges() để xem cấu trúc của nó.
ranges(ABCD1)
Nếu bạn cần chính xác 2 cửa sổ với step = 1L, độ rộng tối đa cho mỗi cửa sổ sẽ là bao nhiêu?
Bài tập này là một phần của khóa học
Giới thiệu Bioconductor trong R
Bài tập tương tác thực hành
Biến lý thuyết thành hành động với một trong các bài tập tương tác của chúng tôi
Bắt đầu bài tập