Thao tác với Biostrings
Sử dụng một chuỗi ngắn (dna_seq) từ đối tượng zikaVirus, giờ là lúc bạn thực hành hai quá trình sinh học: phiên mã (transcription) và dịch mã (translation).
Trong hai phần đầu của bài tập này, bạn sẽ áp dụng từng quá trình riêng biệt. Ở phần cuối, bạn sẽ thực hiện chúng trong một bước.
Bạn sẽ dùng một chuỗi rất nhỏ trong bài này, nhưng hãy nhớ sức mạnh của Biostrings thực sự phát huy khi thao tác với các chuỗi lớn hơn nhiều.
Gói Biostrings đã được nạp sẵn cho bạn. Dùng zikaVirus, bạn sẽ dịch 21 ký tự đầu tiên thành một AAString.
Bài tập này là một phần của khóa học
Giới thiệu Bioconductor trong R
Bài tập tương tác thực hành trực tiếp
Hãy thử làm bài tập này bằng cách hoàn thành đoạn mã mẫu này.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq