1. Học hỏi
    2. /
  2. Khoa Học
    3. /
  3. Giới thiệu Bioconductor trong R
Connected

Bài tập

Thao tác với Biostrings

Sử dụng một chuỗi ngắn (dna_seq) từ đối tượng zikaVirus, giờ là lúc bạn thực hành hai quá trình sinh học: phiên mã (transcription) và dịch mã (translation).

Trong hai phần đầu của bài tập này, bạn sẽ áp dụng từng quá trình riêng biệt. Ở phần cuối, bạn sẽ thực hiện chúng trong một bước.

Bạn sẽ dùng một chuỗi rất nhỏ trong bài này, nhưng hãy nhớ sức mạnh của Biostrings thực sự phát huy khi thao tác với các chuỗi lớn hơn nhiều.

Gói Biostrings đã được nạp sẵn cho bạn. Dùng zikaVirus, bạn sẽ dịch 21 ký tự đầu tiên thành một AAString.

Hướng dẫn 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • Dùng unlist() với tập zikaVirus và chọn 21 cặp base đầu tiên bằng subseq(). Đối tượng tạo ra sẽ là một đối tượng "DNAString".
  • Phiên mã dna_seq thành một "RNAString" và gán vào rna_seq.