Khám phá chất lượng chuỗi

Đến lượt bạn thực hiện kiểm soát chất lượng cho fqsample. Đây là bước quan trọng trước khi phân tích sâu hơn để nhanh chóng phát hiện các vấn đề của dữ liệu.

Để kiểm tra giá trị mã hóa cho từng ký tự trong quality(), hãy dùng encoding():

encoding(quality(fqsample))

Để có bản tóm tắt đánh giá chất lượng (QA), dùng qa():

qaSummary <- qa(fqsample, type = "fastq", lane = 1)

qaSummary này đã được tạo sẵn cho bạn. Có thể truy cập các phần tử QA bằng qaSummary[["nameElement"]], trong đó nameElement là tên phần tử bạn muốn xem.

Nạp ShortRead.
Kiểm tra chất lượng của tệp chuỗi fqsample.

Bài tập

Khám phá chất lượng chuỗi

Hướng dẫn 1/3

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}Bài tập

Hướng dẫn 1/3

Bài tập