1. सीखें
    2. /
  2. पाठ्यक्रम
    3. /
  3. Giới thiệu Bioconductor trong R
Connected

अभ्यास

Tìm vùng bảo tồn trong sáu khung đọc

Chúc mừng bạn đã đi đến bước này!

Giờ bạn sẽ tìm kiếm trình tự protein NS5 trong trình tự virus Zika. NS5 là một protein virus được bảo tồn cao. Trình tự này đã được tải xuống và nạp sẵn cho bạn từ Uniprot.

Trình tự DNA của virus Zika đã được phiên mã thành một RNAStringSet, tên là rnaframesZikaSet. Bộ này có sáu khung đọc (mỗi trình tự là một khung) để bạn dịch sang các axit amin. Khi tìm kiếm, bạn sẽ đặt tham số max.mismatch trong lời gọi vcountPattern() để tăng độ linh hoạt cho việc tìm khớp.

निर्देश 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • In rnaframesZikaSet.
  • Dịch cả 6 khung đọc sang axit amin và in kết quả.