Loại bỏ bản sao (duplicates)
Việc kiểm tra rằng các read của bạn không chứa quá nhiều bản sao luôn là một thói quen tốt.
# Mẫu có bản sao thuộc lớp: ShortReadQ
dfqsample
# Lấy các read từ dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)
# Đếm số bản sao
table(srduplicated(mydReads))
Bạn sẽ loại bỏ các read trùng lặp trong một tệp như thế nào? Hãy chú ý điều kiện cần dùng trong bộ lọc này.
Bài tập này là một phần của khóa học
Giới thiệu Bioconductor trong R
Bài tập tương tác thực hành
Biến lý thuyết thành hành động với một trong các bài tập tương tác của chúng tôi
Bắt đầu bài tập