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DGE 理論:メタデータ

以下の情報をもとに、線維症カウントデータ用のメタデータデータフレーム metadata を作成しましょう。列名は genotypecondition とし、サンプル名(例:smoc2_fibrosis1smoc2_fibrosis2 など)をデータフレームの行名に設定してください。

smoc2 metadata

この演習はコースの一部です

RNA-Seq with Bioconductor in R

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演習の手順

  • c() を使って、上記データの genotype という名前の文字ベクトルを作成してください。
  • c() を使って、上記データの condition という名前の文字ベクトルを作成してください。
  • data.frame()genotypecondition の文字ベクトルを使って、smoc2_metadata というデータフレームを作成してください。
  • c() を使ってサンプル名のベクトルを作成し、rownames() を使ってデータフレームの行名に割り当ててください。

実践的なインタラクティブ演習

このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。

# Create genotype vector
genotype <- c(___)

# Create condition vector
condition <- c(___)

# Create data frame
smoc2_metadata <- data.frame(___, ___)

# Assign the row names of the data frame
rownames(smoc2_metadata) <- c(___)
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