DESeq2 の可視化 - MA プロットとボルケーノプロット

注意： この演習の読み込みに少し時間がかかる場合があります。

結果を探索するには、データ全体の概観や有意な遺伝子の特徴を把握するために、可視化が有効です。通常、有意な遺伝子は平均値のさまざまな範囲にわたって検出されることが期待されており、これを MA プロットで確認できます。高い平均値を持つ遺伝子にのみ有意差が見られる場合は、データに問題がある可能性があります。ボルケーノプロットは、有意差を判定するために必要なフォールドチェンジの範囲を把握するのに役立ちます。

MA プロットとボルケーノプロットを使って、結果を探索しましょう。