始める無料で始める

DESeq2 ビネットを使った練習

動画では、野生型マウスの正常サンプルと線維症サンプル間の遺伝子発現の違いを探っています。この演習では、smoc2 遺伝子を過剰発現させたマウスの正常サンプルと線維症サンプル間の遺伝子発現を調べます。

差次的発現解析を自分で行う際、DESeq2 ビネットは疑問への答えを探す最初の参照先となります。この演習では、DESeq2 ビネット を参照し、以下の質問に最もよく当てはまる答えを選んでください。

なぜ DESeq2 への入力には 未正規化 カウントを使用するのでしょうか?

注意: 未正規化 とは、サンプルごとにカウントされたリード総数(ライブラリサイズ)に基づく補正が行われていないカウントのことです。

この演習はコースの一部です

RNA-Seq with Bioconductor in R

コースを見る

実践的なインタラクティブ演習

理論を実践に変える、インタラクティブな演習のひとつをお試しください

演習を開始する