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演習

DESeq2 モデル - 結果の抽出

注意： この演習の読み込みに少し時間がかかる場合があります。

分散を確認し、データが DESeq2 モデルに適合していると判断したら、次は結果を抽出しましょう。

DESeq2 オブジェクト dds_smoc2 の作成と DESeq() 関数の実行を含む、これまでの手順はすべて完了しているものとします。

指示

100 XP
  • results() 関数を使って、アルファ値 0.05 でコントラストを指定します。対象条件 condition について、normal サンプルグループを基準レベルとし、fibrosis サンプルグループとの比較結果を出力してください。