DESeq2 の有意な結果
注意: この演習の読み込みには少し時間がかかる場合があります。
それでは、有意な結果を抽出しましょう。前の演習で抽出した結果 smoc2_res が手元にあると仮定して進めます。
この演習はコースの一部です
RNA-Seq with Bioconductor in R
演習の手順
data.frame()関数を使って、結果オブジェクトsmoc2_resをデータフレームとして保存します。subset()関数を使って、補正済み p 値が 0.05(アルファ値)未満の有意な遺伝子を抽出します。
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Save results as a data frame
smoc2_res_all <- ___(___)
# Subset the results to only return the significant genes with p-adjusted values less than 0.05
smoc2_res_sig <- ___(___, ___ < ___)