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DESeq2 の有意な結果

注意: この演習の読み込みには少し時間がかかる場合があります。

それでは、有意な結果を抽出しましょう。前の演習で抽出した結果 smoc2_res が手元にあると仮定して進めます。

この演習はコースの一部です

RNA-Seq with Bioconductor in R

コースを見る

演習の手順

  • data.frame() 関数を使って、結果オブジェクト smoc2_res をデータフレームとして保存します。

  • subset() 関数を使って、補正済み p 値が 0.05(アルファ値)未満の有意な遺伝子を抽出します。

実践的なインタラクティブ演習

このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。

# Save results as a data frame
smoc2_res_all <- ___(___)

# Subset the results to only return the significant genes with p-adjusted values less than 0.05
smoc2_res_sig <- ___(___, ___ < ___)
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