DESeq2 結果の要約
注意: この演習の読み込みに少し時間がかかる場合があります。
結果を抽出したので、summary() 関数を使って、指定した有意水準(alpha)における差次的発現遺伝子の数をわかりやすく確認しましょう。この関数は、発現が上昇・低下した遺伝子の数と割合を出力するほか、独立フィルタリングや除外された外れ値に関する情報も表示します。
この演習はコースの一部です
RNA-Seq with Bioconductor in R
演習の手順
DESeq2のsummary()関数を使って、結果オブジェクトsmoc2_resに含まれる差次的発現遺伝子の数を確認しましょう。
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
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