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演習

DESeq2 結果の要約

注意: この演習の読み込みに少し時間がかかる場合があります。

結果を抽出したので、summary() 関数を使って、指定した有意水準(alpha)における差次的発現遺伝子の数をわかりやすく確認しましょう。この関数は、発現が上昇・低下した遺伝子の数と割合を出力するほか、独立フィルタリングや除外された外れ値に関する情報も表示します。

指示

100 XP
  • DESeq2 の summary() 関数を使って、結果オブジェクト smoc2_res に含まれる差次的発現遺伝子の数を確認しましょう。