Quali picchi sono diversi?

Diamo un'occhiata a quanto differiscono i campioni in termini di chiamate di picco. Considerando i picchi uniti con cui hai già lavorato, quanti picchi sono condivisi tra campioni diversi?

Un grafico utile per rispondere è un diagramma di Venn. Puoi crearlo direttamente dall'oggetto DBA usando la funzione dba.plotVenn(). In alternativa, puoi usare un UpSet plot, che puoi creare con il pacchetto UpSetR. Questo sostituisce le ellissi di un diagramma di Venn con una serie di grafici a barre che indicano la dimensione dei vari sottoinsiemi. La funzione upset() richiede un data frame con una colonna per ogni insieme, cioè per ogni campione, che indichi l'appartenenza all'insieme per ciascun picco. I dati necessari si trovano nel campo called dell'oggetto ar_diff.