Cromosoma X del genoma humano
Ahora te toca usar el paquete TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene y extraer información de él. Como en el vídeo, vas a filtrar todos los genes del cromosoma X usando la función genes() con el argumento filter configurado para seleccionar los casos donde tx_chrom = "chrX". Después, explorarás este subconjunto de genes.
Recuerda que filter recibe una list() de condiciones para seleccionar intervalos específicos del genoma.
Si quieres probar otros filtros, los nombres válidos para esta lista son: "gene_id", "tx_id", "tx_name", "tx_chrom", "tx_strand", "exon_id", "exon_name", "exon_chrom", "exon_strand", "cds_id", "cds_name", "cds_chrom", "cds_strand" y "exon_rank".
Este ejercicio forma parte del curso
Introducción a Bioconductor en R
Ejercicio interactivo práctico
Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.
# Load human reference genome hg38
library(___)
# Assign hg38 to hg, then print it
___
hg