Explorando la secuencia del virus del Zika
Ahora te toca explorar el genoma del virus del Zika, que ya está cargado en tu espacio de trabajo como zikaVirus. El genoma se descargó de NCBI y puedes aplicar funciones de Biostrings para saber más sobre él.
Empieza comprobando el alfabeto de la secuencia.
alphabet() # Muestra las letras incluidas en la secuencia
alphabetFrequency() # Muestra los recuentos por letra
Recuerda del vídeo que cada alfabeto corresponde a un contenedor biostring específico, y que cada alfabeto suele incluir letras y símbolos adicionales.
Este ejercicio forma parte del curso
Introducción a Bioconductor en R
Ejercicio interactivo práctico
Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
___