Funciones comunes para manipular secuencias
Hasta ahora, has aprendido las funciones de manipulación de secuencias más comunes:
reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()
En la práctica, puedes manipular secuencias realmente grandes usando estas funciones.
Sin embargo, para apreciar el valor y los resultados de estas funciones en este ejercicio, usarás un subconjunto pequeño. El objeto zikv, que has extraído previamente del genoma del Zika, tiene solo 30 bases.
Este ejercicio forma parte del curso
Introducción a Bioconductor en R
Instrucciones del ejercicio
Prueba las funciones usando zikv:
- Invierte la secuencia.
- Obtén el complemento de la secuencia.
- Calcula el complemento inverso de la secuencia.
- Traduce la secuencia.
Ejercicio interactivo práctico
Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.
# Reverse the zikv sequence
reverse(___)
# Complement the zikv sequence
___
# Reverse complement the zikv sequence
___
# Translate the zikv sequence
___