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人類基因組 X 染色體

輪到你使用 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene 套件並從中擷取資訊了。和影片中一樣,你將使用 genes() 函式並將引數 filter 設定為選取 tx_chrom = "chrX" 的條件,來篩選出 X 染色體上的所有基因。接著,探索這個基因子集合。

記得 filter 會接收一個 list(),其中包含選取特定基因組區間的篩選條件。

如果你想嘗試其他篩選條件,這個 list 可用的名稱包括:"gene_id""tx_id""tx_name""tx_chrom""tx_strand""exon_id""exon_name""exon_chrom""exon_strand""cds_id""cds_name""cds_chrom""cds_strand",以及 "exon_rank"

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# Load human reference genome hg38
library(___)

# Assign hg38 to hg, then print it
___
hg
編輯並執行程式碼