在六個閱讀框中尋找保守區域
恭喜你一路學到這裡!
現在你要在茲卡病毒的序列中尋找 NS5 蛋白質序列。NS5 是一個高度保守的病毒蛋白。它已經替你從 Uniprot 下載並載入。
茲卡病毒的 DNA 序列已轉錄成 RNAStringSet,名為 rnaframesZikaSet。這個集合包含 6 個閱讀框(每個序列一個),供你翻譯成胺基酸。在進行搜尋時,你會在呼叫 vcountPattern() 時設定 max.mismatch 參數,讓搜尋更有彈性。
本練習屬於課程
R 中的 Bioconductor 入門
動手互動練習
試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。
# Print rnaframesZikaSet
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# Translate rnaframesZikaSet
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