常見的序列操作函式
到目前為止,你已經學會最常見的序列操作函式:
reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()
在實務中,你可以用這些函式處理非常長的序列。
不過,為了在本練習中更清楚看到這些函式的價值與結果,你會使用一小段子集。物件 zikv 是你先前從 Zika 基因組擷取的子序列,只有 30 個鹼基。
本練習屬於課程
R 中的 Bioconductor 入門
練習說明
使用 zikv 測試下列函式:
- 將序列反轉。
- 取得序列的互補序列。
- 取得序列的反向互補。
- 將序列進行轉譯。
動手互動練習
試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。
# Reverse the zikv sequence
reverse(___)
# Complement the zikv sequence
___
# Reverse complement the zikv sequence
___
# Translate the zikv sequence
___