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常見的序列操作函式

到目前為止,你已經學會最常見的序列操作函式:

reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()

在實務中,你可以用這些函式處理非常長的序列。

不過,為了在本練習中更清楚看到這些函式的價值與結果,你會使用一小段子集。物件 zikv 是你先前從 Zika 基因組擷取的子序列,只有 30 個鹼基。

本練習屬於課程

R 中的 Bioconductor 入門

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練習說明

使用 zikv 測試下列函式:

  • 將序列反轉。
  • 取得序列的互補序列。
  • 取得序列的反向互補。
  • 將序列進行轉譯。

動手互動練習

試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。

# Reverse the zikv sequence
reverse(___)

# Complement the zikv sequence
___

# Reverse complement the zikv sequence
___

# Translate the zikv sequence
___
編輯並執行程式碼