GenomicRanges 存取器
在前一個練習中,你從包含基本資訊的資料框建立了一個 GRanges 物件。你會發現 GRanges 還能存更多資訊!
請使用存取器方法來探索 GRanges 物件 myGR。你可以從 GRanges 物件中擷取多種特徵,例如染色體名稱、序列數量、各序列名稱、鏈向(strand)、分數(score)、長度等。
以下是 GRanges 的基本存取器:
seqnames(gr)
ranges(gr)
mcols(gr)
genome(gr)
seqinfo(gr)
如需完整的存取器清單,請查看 methods(class = "GRanges")。
本練習屬於課程
R 中的 Bioconductor 入門
練習說明
- 取得
myGR的序列資訊。 - 使用
mcols()檢查中介資料(metadata)。
動手互動練習
試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。
# Load GenomicRanges
library(___)
# Print the seqinfo of myGR
___
# Check the metadata
___