搜尋特定樣式
讓我們用 vmatchPattern() 在 zikaVirus 集合 中找出某個樣式的出現位置。接著,對單一序列 zikv 使用 matchPattern() 進行相同的樣式搜尋。
# For Sets
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)
# For single sequences
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikv, max.mismatch = 1)
兩個函式找到的出現次數應該相同,但你會注意到輸出格式不同。 分別執行每個樣式搜尋時,會得到多少個比對?
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