探索茲卡病毒序列
換你來探索茲卡病毒的基因體。它已載入到你的工作環境為 zikaVirus。這個基因體是從 NCBI 下載的,你可以套用 Biostrings 的函式來更深入了解。
先從檢查序列的字母表開始。
alphabet() # 顯示序列中涵蓋的字母
alphabetFrequency() # 顯示各字母的計數
請記得在影片中提到,每一種字母表都對應到特定的 biostrings 容器,而每種字母表通常還包含額外的代碼字母與符號。
本練習屬於課程
R 中的 Bioconductor 入門
動手互動練習
試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
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