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更多過濾!

太棒了!既然你已經練習過如何過濾 reads,現在來使用 polynFilter() 函式吧。這個函式會挑出重複核苷酸數量少於指定閾值的 reads。舉例來說,polynFilter(threshold = 20, nuc = c("A")) 會選出所有含有少於 20 個 A 的 reads。參數 nuc 是一個字元向量,內容可以是核苷酸的 IUPAC 符號,或使用 "other" 代表所有非核苷酸的符號。

你的工作環境中已提供 fqsample 物件。

本練習屬於課程

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試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。

# Check reads of fqsample
___

# Create myFil using polynFilter
myFil  <- ___

# Check myFil
myFil
編輯並執行程式碼