探索 fastq 檔案

Fastq 檔案通常包含成千上萬甚至上百萬個 reads，檔案體積會非常大！在這個練習中，你會使用一個只有 500 個 reads 的小型 fastq 子樣本，能夠輕鬆載入記憶體，並可用 readFastq() 一次完整讀入。

原始的序列檔案來自阿拉伯芥（Arabidopsis thaliana），由 UC Davis Genome Center 提供。其 accession number 為 SRR1971253，下載自 Sequence Read Archive（SRA）。它包含來自葉片組織的 DNA，經過混合後使用 Illumina HiSeq 2000 定序。這些序列為單端讀取（single-read），長度為 50 個鹼基（bp）。

fqsample 是一個 ShortReadQ 物件，包含 reads、品質分數與 id 的相關資訊。輪到你來探索它了！