मानव जीनोम क्रोमोसोम X
अब आपकी बारी है कि आप TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene पैकेज का उपयोग करें और उससे जानकारी निकालें। वीडियो की तरह, आप genes() फंक्शन का उपयोग करेंगे और आर्ग्युमेंट filter सेट करेंगे ताकि वे इंस्टेंस चुने जाएँ जहाँ tx_chrom = "chrX" हो, यानी क्रोमोसोम X के सभी genes का सबसेट बनाएँ। फिर आप इस genes के सबसेट को एक्सप्लोर करेंगे.
याद रखिए, filter एक list() में दी गई शर्तें लेता है ताकि विशिष्ट genome intervals चुने जा सकें.
यदि आप अन्य फ़िल्टर्स आज़माना चाहें, तो इस लिस्ट के मान्य नाम हैं: "gene_id", "tx_id", "tx_name", "tx_chrom", "tx_strand", "exon_id", "exon_name", "exon_chrom", "exon_strand", "cds_id", "cds_name", "cds_chrom", "cds_strand", और "exon_rank".
यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है
R में Bioconductor परिचय
इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास
इस अभ्यास को इस नमूना कोड को पूरा करके आज़माएँ।
# Load human reference genome hg38
library(___)
# Assign hg38 to hg, then print it
___
hg