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एक sequence विंडो

अपनी sequences के हिस्सों को अस्थायी रूप से विभाजित करने के लिए, आप निश्चित चौड़ाई वाली विंडो का उपयोग करेंगे जो स्टेप्स में move कर सकती हैं. जैसा कि आप ने वीडियो में देखा, GRanges slidingWindows() फंक्शन देता है, जिसमें width और step जैसे arguments होते हैं.

slidingWindows(x, width, step = 1L)

इस अभ्यास के लिए GRanges ऑब्जेक्ट ABCD1 प्री-लोड किया गया है, जिसका gene id 215 है और length 19895 है. इसकी संरचना देखने के लिए ranges() फंक्शन का उपयोग करें.

ranges(ABCD1)

यदि आपको step = 1L के साथ ठीक 2 विंडो चाहिए, तो हर विंडो की चौड़ाई (width) के लिए अधिकतम मान कितना होगा?

यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है

R में Bioconductor परिचय

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