कॉमन sequence manipulation फंक्शन
अब तक, आपने सबसे कॉमन sequence manipulation फंक्शन सीखे हैं:
reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()
व्यवहार में, आप इन फंक्शन की मदद से बहुत बड़े सीक्वेंस भी मैनिपुलेट कर सकते हैं.
लेकिन, इस अभ्यास में इन फंक्शन का महत्व और उनके नतीजे साफ़ देखने के लिए आप एक छोटा सबसेट उपयोग करेंगे. ऑब्जेक्ट zikv, जिसे आपने पहले Zika जीनोम से सबसेट किया था, में सिर्फ 30 बेस हैं.
यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है
R में Bioconductor परिचय
अभ्यास निर्देश
zikv का उपयोग करके फंक्शन टेस्ट करें:
- सीक्वेंस को रिवर्स करें.
- सीक्वेंस का कॉम्प्लीमेंट लें.
- सीक्वेंस का रिवर्स कॉम्प्लीमेंट लें.
- सीक्वेंस को ट्रांसलेट करें.
इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास
इस अभ्यास को इस नमूना कोड को पूरा करके आज़माएँ।
# Reverse the zikv sequence
reverse(___)
# Complement the zikv sequence
___
# Reverse complement the zikv sequence
___
# Translate the zikv sequence
___